2016-2017 Ziraat Türkiye Kupası 2. Eleme Turu Kura Çekimi yapıldı. TFF'nin Beykoz-Riva'daki idari merkezinde bulunan Orhan Saka Salonu'nda gerçekleştirilecek kura çekimi sonunda eşleşmeler belli oldu. Temsilcilerimiz Anadolu Selçukspor Altınordu, Sarayönü Belediyespor ise Elazığspor ile eşleşti.  Tek maç eleme usulüne göre oynanacak müsabakalar sonucunda rakiplerini geçen 49 takım, bir üst tura yükselecek. Organizasyonda 2. eleme turu maçları 20, 21 ve 22 Eylül'de oynanacak. Atiker Konyaspor kupaya grup aşamasından katılacak.